Wikimédia France est administrée par un conseil de 12 membres maximum. Ces membres sont élus par les adhérents de l’association réunis lors de l’assemblée générale annuelle. Le conseil d’administration comporte lui-même un bureau composé du président, du vice-président, du trésorier et du secrétaire.

Renouvelé lors de l’assemblée générale du 22 novembre 2025, le conseil d’administration est actuellement composé de 12 membres.